The Chinese journal of clinical pharmacology
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2024 , (12)
: 1827-1831.
DOI:
10.13699/j.cnki.1001-6821.2024.12.027
泛癌分析揭示SPP1与多种肿瘤的临床预后相关性
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Abstract
目的 通过生物信息学方法分析分泌性磷酸蛋白(SPP1)在肿瘤中的功能作用,评估在人类泛癌中的差异表达和预后价值。方法 癌症样本数据来自the Cancer Genome Atlas(TCGA)、Genetype-tissue Expression(GTEx)数据库,利用CPTAC数据库研究SPP1在泛癌中的基因差异表达,利用GEPIA2数据库研究SPP1与患者生存预后之间的相关性,利用CbioPortal工具评估SPP1在32种肿瘤中的基因突变改变形式。结果 在32种肿瘤类型中,SPP1 mRNA表达在8种癌症中有差异,仅在肾透明细胞癌中蛋白表达下降,其余癌症中蛋白表达均增加,基因的表达在肿瘤分期中具有特异性;SPP1 mRNA的表达与患者的总生存期(OS)和无病生存期(DFS)呈负相关;SPP1在肿瘤中的基因活性与低甲基化相关,即低甲基化可以激活致癌基因进而影响肿瘤细胞的生成、凋亡、增生,进一步影响肿瘤的发生发展;SPP1以错义突变为主要基因突变形式,基因的改变与前列腺癌、胃癌患者较差的预后相关。结论 基于泛癌分析成功验证了SPP1在人类癌症中的特异性,特异性表达与癌症患者的临床预后紧密相关,说明SPP1可以作为癌症预后的靶点。
Keywords
分泌性磷酸蛋白; 预后; DNA甲基化; 基因突变; 泛癌分析
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